Es un libro que consta de 34 hojas de papel europeo empastado en pergamino. Temáticamente se trata de un registro de anales del Convento de San Mateo Huichapan de 1539 a 1618 y de 1629 a 1632. También hay un calendario otomí y su correlación con los calendarios mexicano y cristiano. Al final se observan algunos textos de carácter histórico con ilustraciones. El documento se divide en cuatro partes, la primera parte consta de seis páginas más un fragmento escrito en otomí, en esta parte se distinguen palabras en español y los años alineados siempre a la derecha. Enseguida se observan dos páginas con una lista de glifos de lugar que indican su significado con una leyenda debajo de cada uno. A continuación se registra un calendario que se divide en cuatro columnas. De izquierda a derecha la primera columna corresponde a los meses cristianos, después los signos del zodiaco, los meses en náhuatl y al final en otomí.

Las 55 páginas restantes tienen una estructura similar. Junto al margen inferior se observan algunos cuadretes con glifos calendaricos y su equivalente en años cristianos, estos empiezan en 1403 y terminan en 1528. Arriba se observan figuras de lugares, objetos, personajes, muertos y textos. Tenochtitlan, Cuauhtitlan y Jilotepec aparecen entre los lugares mencionados.

Si bien este códice es atribuido a Juan de San Francisco, noble otomí del pueblo de Huichapan, Alfonso Caso identificó durante su estudio una firma en ell reverso de una de las pastas: Fray Felipe de Santiago.